More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2254 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  100 
 
 		 362 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  33.98 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  32.65 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  33.16 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  28.77 
 
 		 504 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  24.53 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  30.54 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  27.25 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  25.87 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  24.79 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  25.97 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 331 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 		 518 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  31.17 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  25.55 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  32.46 
 
 		 501 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  24.86 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  27.92 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  29.29 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.47 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  30.39 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  29.19 
 
 		 726 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  34.18 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  29.65 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  25.88 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  27.09 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  26.77 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  26.24 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  29.07 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  27.57 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  27.57 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.72 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  24.77 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  27.45 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.23 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  26.9 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.31 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  29.48 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  25.33 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  25.1 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  25.08 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  27.75 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 581 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  25.73 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  25.27 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  27.88 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  25.11 
 
 		 831 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  26.56 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4248  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  26.05 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  24.54 
 
 		 1018 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  26.04 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  23.78 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  27.64 
 
 		 645 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  26.04 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 559 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>