More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4002 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 338 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  53.39 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  52.05 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  50 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  34.42 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  39.21 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  38.67 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  40.18 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  42.78 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  37.78 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  37.19 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  40.5 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  35.75 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  43.3 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  40.5 
 
 		 1021 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  36.76 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  33.1 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  42.65 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  35.34 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  36.99 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  39.25 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  33.18 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  35.27 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  39.59 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  32.26 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  36.14 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  40.51 
 
 		 448 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  36.76 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 578 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.61 
 
 		 576 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  36.46 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  31.49 
 
 		 576 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 523 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.47 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  35.11 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 591 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  32.77 
 
 		 556 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  36.42 
 
 		 558 aa  99.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  28.35 
 
 		 394 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 559 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  28.71 
 
 		 1016 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  40 
 
 		 556 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  28.83 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 465 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 403 aa  96.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 433 aa  96.3  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 		 559 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.47 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  40 
 
 		 556 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.49 
 
 		 522 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  39.09 
 
 		 591 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  31.79 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  34.03 
 
 		 561 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 561 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 558 aa  93.2  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 563 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 558 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  28.27 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.11 
 
 		 589 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  26.36 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 589 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 565 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>