More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1843 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 418 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  41.07 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 413 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  40.18 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 		 395 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  37.76 
 
 		 364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  32.43 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  41.38 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  38.05 
 
 		 518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  38.43 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  40.59 
 
 		 354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 352 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  44.95 
 
 		 504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  35.02 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  40.26 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  39.76 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  37.61 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 355 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  40.4 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  35.83 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  35.37 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  38.42 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  36.54 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  35.14 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  34.16 
 
 		 349 aa  136  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  36.19 
 
 		 331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  37.38 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  37.57 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  38.54 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  35.5 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  35.71 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  30.8 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.62 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  31.49 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.26 
 
 		 303 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  33.64 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  32.26 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  29.91 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  31.8 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  33.33 
 
 		 568 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  30.4 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  32.65 
 
 		 572 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  32.65 
 
 		 572 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 362 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  33.82 
 
 		 610 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  29.68 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  34.01 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 339 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  29.7 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  30.96 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 340 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.69 
 
 		 576 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  30.74 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 561 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 380 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  31.72 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>