More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1178 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 413 aa  851    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  42.68 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  35.93 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  46.02 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  43.84 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  44.16 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  44.29 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  33.24 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  38.93 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  44.55 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  40.17 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  41.29 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  40.5 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  37.66 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  37.2 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 518 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  31.14 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  36.44 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  40.38 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  37.33 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  28.64 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  39.23 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  39.61 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  41.09 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  35.34 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  35.59 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  38.22 
 
 		 501 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  36.22 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  35.11 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  37.99 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  39.9 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  39.23 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  34.84 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  38.74 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  37.04 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  29.68 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  31.38 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.99 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  35.42 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  30.81 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  36.57 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  31.82 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  32.68 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  35.2 
 
 		 345 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 578 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  34.24 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  31.69 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 576 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  29.33 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  32.41 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 831 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 645 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  29.86 
 
 		 726 aa  93.2  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  30.6 
 
 		 1016 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  32.66 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  35.37 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  33.14 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  33.84 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 257 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4248  sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 257 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 448 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  35.35 
 
 		 564 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 342 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>