More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0992 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 353 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  27.46 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  31.05 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  34.82 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  27.97 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  40.34 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  29.88 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  28.72 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  37.06 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  31.1 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  27.3 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  29.13 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  31.49 
 
 		 418 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.38 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  33.83 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  29.62 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  33.79 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  30.25 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  26.92 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.35 
 
 		 578 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  36.43 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  25.86 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  36.78 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  29.65 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  28.94 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  28.51 
 
 		 504 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  31.75 
 
 		 726 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  28.71 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  29.01 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  34.66 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  30 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  28.25 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  29.85 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 501 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  25.84 
 
 		 491 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  34.05 
 
 		 557 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  34.05 
 
 		 557 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 557 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.72 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 557 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 557 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  26.42 
 
 		 482 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 557 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  24.7 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  31.69 
 
 		 552 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  27.69 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  26.71 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  27.75 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3518  two component sensor protein  32.43 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 561 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.88 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  27.55 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 446 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 561 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  32.78 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 561 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  29.2 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 388 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 		 645 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 831 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  25.13 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>