More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4283 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 349 aa  719    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  31.6 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  38.66 
 
 		 504 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  35.21 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  37.57 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  34.69 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  33.64 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  29.05 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  36.67 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  35.98 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  38.34 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  32.43 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  35.44 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  34.62 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  28.93 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  28.62 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  25.71 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  33.76 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  28.16 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  24.92 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  33.84 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  27.55 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  35.94 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  33.98 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 465 aa  99.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  28.42 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 361 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  31.09 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  31.91 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 		 568 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  31.37 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  30.16 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  30.49 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  27.69 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  29.05 
 
 		 482 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  29.61 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 448 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 578 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  31.72 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  28.87 
 
 		 367 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  30.46 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  31.35 
 
 		 558 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 558 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  31.68 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  28.08 
 
 		 579 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 		 581 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  28.7 
 
 		 581 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  27.85 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 563 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  25.52 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  24.51 
 
 		 831 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  27.8 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  28.11 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  29.95 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>