More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0308 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 357 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  33.24 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  33.62 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  32.17 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  36.24 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  35.42 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  39.19 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  36.73 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  40.82 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  35.78 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.5 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  38.38 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  39.89 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  35.19 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  37.05 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  34.59 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  37.91 
 
 		 445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  32.58 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 		 1021 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.97 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  29.45 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.66 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  29.18 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  30.08 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  32.43 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  31.94 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  28.25 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 446 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  27.48 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  27.44 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  28.41 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  32.49 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  34.76 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  33.15 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  28.11 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  27.17 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  29.85 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  28.29 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.01 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  32.02 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  26.27 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.35 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  30.11 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  25.26 
 
 		 518 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  25.35 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  26.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.08 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  29.18 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.52 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  28.42 
 
 		 726 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  28.93 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  30.95 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  26.37 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 565 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 559 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>