More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11998 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  922    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  47.97 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  42.08 
 
 
312 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  39.57 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 
338 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  39.82 
 
 
342 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  40.18 
 
 
345 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  43.09 
 
 
362 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  37.12 
 
 
1021 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  38.12 
 
 
375 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 
343 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  40.54 
 
 
362 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  37.78 
 
 
380 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 
342 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  41.38 
 
 
366 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  38.76 
 
 
344 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  32.25 
 
 
342 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  32.95 
 
 
339 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  32.88 
 
 
340 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  43.24 
 
 
341 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  39.23 
 
 
339 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 
333 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  37.86 
 
 
342 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  36.99 
 
 
362 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  35.78 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  35.62 
 
 
359 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 
364 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  44.5 
 
 
448 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  35.56 
 
 
342 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  32.21 
 
 
342 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  31.42 
 
 
391 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 
352 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  38.12 
 
 
351 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 
372 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 
343 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 
359 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 
366 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  42.11 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  30.96 
 
 
523 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 
365 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 
323 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  36.9 
 
 
370 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  29.48 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 
331 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 
381 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.02 
 
 
352 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 
552 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  25.94 
 
 
367 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  29.36 
 
 
642 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
491 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  27.14 
 
 
418 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
831 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  27.94 
 
 
572 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  27.85 
 
 
572 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
357 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  32.79 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 
350 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  28.03 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.16 
 
 
362 aa  87.4  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 
387 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 
561 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  28.23 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  27 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  26.73 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  30.95 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  28.57 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  28 
 
 
726 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  33.53 
 
 
575 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  29.52 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  41.07 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  27.23 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  37.36 
 
 
586 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  31.31 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  26.87 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 
557 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 
557 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 
557 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  28.28 
 
 
354 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 
557 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  27.91 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 
1016 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 
566 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  31.44 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  28.87 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>