More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0602 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 356 aa  733    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  35.67 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 		 359 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  32.46 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  33.74 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  41.21 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  29.05 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  28.39 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  42.11 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  32.61 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 399 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  33.47 
 
 		 1021 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  28.27 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 343 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  28.17 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.96 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  29.34 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  31.78 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  34.32 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  27.16 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  27.16 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.09 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  26.75 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  34.33 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  24.25 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  27.67 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  25.51 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  27.13 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  31.9 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.19 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  28.82 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  32.73 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  24.89 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.06 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  31.76 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  29.94 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  26.64 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  27.71 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  29.77 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  30.51 
 
 		 561 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  22.38 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  26.14 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  34.97 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  26.7 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  27.92 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  26.44 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>