More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0836 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 380 aa  775    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  46.15 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  41.58 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  39.42 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  45.45 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  39.7 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  37.78 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  42.42 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  37.72 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  42.44 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  40.7 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  39.01 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  41.18 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 1021 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  42.05 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  37.75 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  39.8 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  38.07 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  38.19 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  39.38 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  34 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  37.83 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  34.53 
 
 		 344 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  36.21 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  37.24 
 
 		 448 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  35.75 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  31.66 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  36.3 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.73 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 581 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  31.66 
 
 		 566 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  31.96 
 
 		 565 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 566 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  31.44 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  32.46 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.58 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  28.48 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  31.44 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 581 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 559 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 1016 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 578 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  35.48 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  33.88 
 
 		 518 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  33.88 
 
 		 518 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  33.17 
 
 		 348 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31 
 
 		 465 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.52 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  31.22 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.22 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  26.58 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.01 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  28.25 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.25 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  30.41 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  29.12 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  29.47 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.65 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.05 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>