More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0757 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 339 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  35.19 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  42.5 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  41.95 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  42.42 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 		 362 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  39.42 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  41.36 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  42.34 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  43.81 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  34.41 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  32.26 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  41.7 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  43.3 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  39.21 
 
 		 1021 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  39.23 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 445 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  38.31 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  37.74 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  39.2 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  37.62 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  38.76 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  38.15 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 333 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  34.73 
 
 		 362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  39.89 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  41.75 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  29.8 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  35.44 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  36.18 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  37.81 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  35.53 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.1 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.57 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 418 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  35.37 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 523 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 		 586 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.71 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 578 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  34.38 
 
 		 642 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  31.48 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  35.9 
 
 		 556 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  28.15 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  33.76 
 
 		 556 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  30.38 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  28.92 
 
 		 726 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  32.79 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  27.94 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  30.53 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  25.62 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.55 
 
 		 600 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  29.89 
 
 		 561 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  27.75 
 
 		 394 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  33.14 
 
 		 408 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  28.65 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 831 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  28.57 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  29.89 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  32.91 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  26.96 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  31.61 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.11 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  27.33 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.65 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  30.86 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  28.85 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  26.04 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>