More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4669 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
523 aa  1061    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  36.44 
 
 
1021 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  36.96 
 
 
399 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  38.62 
 
 
342 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  38.12 
 
 
340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 
342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 
445 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 
333 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 
366 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 
362 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
342 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 
372 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  30.96 
 
 
454 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 
343 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.81 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 
391 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  33.84 
 
 
312 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 
355 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  34.18 
 
 
342 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  37.14 
 
 
364 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 
344 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 
356 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  34.15 
 
 
448 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  30.89 
 
 
375 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 
366 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 
343 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 
338 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 
357 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 
347 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 
342 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 
362 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 
339 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 
339 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 
365 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  31.69 
 
 
351 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 
491 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  35.33 
 
 
359 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  37.43 
 
 
330 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  34.69 
 
 
350 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  32.79 
 
 
482 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  28.49 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.43 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
410 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.31 
 
 
831 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  28.67 
 
 
1016 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  29.53 
 
 
346 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  28.64 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  28.79 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  35.04 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 
586 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  32.73 
 
 
684 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  35.56 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  34.71 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  29.37 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  27.93 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 
374 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  28.77 
 
 
600 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  35.25 
 
 
353 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  32.31 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  39.53 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  39.81 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  28.02 
 
 
342 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  39.02 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
589 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  35.21 
 
 
607 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  26.03 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  29.68 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  29.44 
 
 
726 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  31.33 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  36.36 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  30.38 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>