More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0857 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 342 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  85.96 
 
 		 342 aa  617  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 445 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  31.77 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  32.25 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  34.53 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  34.47 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  29.74 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  31.44 
 
 		 312 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  34.2 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 523 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  37.97 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  34.95 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  28.87 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  40.21 
 
 		 1021 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  31.94 
 
 		 359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  33.88 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  27.94 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  28.52 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 448 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  26.86 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.87 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  27.95 
 
 		 374 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 491 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  30.05 
 
 		 579 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  26.97 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  30.68 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  31.37 
 
 		 418 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  28.01 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  26.9 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  33.53 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  26.7 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.17 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  29.91 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  26.15 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  26.96 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  25.75 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  25.85 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  27.49 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  31.73 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.63 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  26.44 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  31.06 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  24.75 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  35.8 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  28.78 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.21 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  31.25 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  28.65 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  28.65 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  31.22 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  34.09 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  28.36 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  26.2 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  26.57 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  33.74 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  38.26 
 
 		 603 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  29.71 
 
 		 559 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>