More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0934 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  100 
 
 		 336 aa  677    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  33.76 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  37 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  38.01 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.42 
 
 		 576 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  36.93 
 
 		 557 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 367 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  28.95 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  36.14 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 578 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  35.52 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  34.24 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  39.63 
 
 		 577 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  32.14 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  36.09 
 
 		 541 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  36.11 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  33.01 
 
 		 726 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.96 
 
 		 558 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  32.4 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 		 831 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  26.32 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2343  histidine kinase internal region  26.28 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.134589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 384 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  34.44 
 
 		 568 aa  99  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.05 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 563 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  32.65 
 
 		 262 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  29.72 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  34.81 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  42.37 
 
 		 575 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 560 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 560 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 560 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  24.86 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  36.94 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  36.53 
 
 		 560 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  34.73 
 
 		 572 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 561 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  34.73 
 
 		 572 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  37.28 
 
 		 563 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  28.29 
 
 		 566 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 581 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.9 
 
 		 576 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  25.17 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  35.33 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  37.34 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.27 
 
 		 403 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  31.16 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 552 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  40.52 
 
 		 560 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  32.78 
 
 		 569 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 559 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  35.17 
 
 		 581 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  34.64 
 
 		 582 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  35.47 
 
 		 586 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 566 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  42.37 
 
 		 565 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  42.37 
 
 		 565 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  42.37 
 
 		 565 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  42.37 
 
 		 565 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  36.24 
 
 		 558 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 561 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 418 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  30.18 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 581 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 375 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  31.25 
 
 		 556 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 561 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  30.18 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  34.03 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 		 372 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  33.93 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.79 
 
 		 645 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.36 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>