More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0956 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  70.04 
 
 
561 aa  784    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  76.96 
 
 
561 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  57.87 
 
 
557 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  58.44 
 
 
560 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  77.34 
 
 
561 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  69.93 
 
 
565 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  58.44 
 
 
560 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  64.43 
 
 
577 aa  746    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  69.75 
 
 
565 aa  795    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  68.04 
 
 
576 aa  775    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  76.79 
 
 
561 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  60.33 
 
 
560 aa  678    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  63.27 
 
 
568 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  56.06 
 
 
556 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  64.79 
 
 
575 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  58.62 
 
 
565 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  70.94 
 
 
572 aa  821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  56.04 
 
 
556 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  57.35 
 
 
558 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  74.64 
 
 
561 aa  823    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  71.12 
 
 
572 aa  823    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  76.92 
 
 
561 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
563 aa  1155    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  76.96 
 
 
561 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  77.46 
 
 
561 aa  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  70.11 
 
 
565 aa  798    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  57.81 
 
 
560 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  60.25 
 
 
569 aa  673    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  58.35 
 
 
558 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  57.25 
 
 
558 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  77.28 
 
 
561 aa  878    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  76.96 
 
 
561 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  58.26 
 
 
565 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  66.85 
 
 
561 aa  722    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  76.92 
 
 
561 aa  874    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  58.62 
 
 
565 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  60.58 
 
 
565 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  58.62 
 
 
565 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  93.07 
 
 
563 aa  1038    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  75.89 
 
 
562 aa  846    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  58.48 
 
 
558 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  58.08 
 
 
560 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  58.08 
 
 
560 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  55.68 
 
 
556 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  48.28 
 
 
559 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  47.41 
 
 
560 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  47.23 
 
 
560 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  46.76 
 
 
559 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.86 
 
 
576 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  40.25 
 
 
572 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  36.75 
 
 
578 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  37.43 
 
 
576 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 
568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  34.51 
 
 
564 aa  326  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.92 
 
 
567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.1 
 
 
568 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  34.26 
 
 
579 aa  300  5e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.47 
 
 
580 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  33.69 
 
 
603 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  32.01 
 
 
591 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  32.57 
 
 
591 aa  274  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  31.13 
 
 
584 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  31.13 
 
 
584 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
579 aa  273  7e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  31.62 
 
 
587 aa  273  7e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 
589 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.62 
 
 
589 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
589 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
589 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  29.93 
 
 
552 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.62 
 
 
589 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.62 
 
 
589 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.62 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.45 
 
 
589 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.28 
 
 
589 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 
563 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  31.93 
 
 
581 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 
581 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  32.63 
 
 
522 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 
565 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 
566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 
566 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 
446 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  28.84 
 
 
565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  28.84 
 
 
565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  28.84 
 
 
565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 
557 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
559 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  37.22 
 
 
450 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
559 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
559 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
559 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  28.62 
 
 
559 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
559 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>