More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3732 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  100 
 
 		 726 aa  1489    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.67 
 
 		 370 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  37.61 
 
 		 346 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  26.83 
 
 		 367 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.82 
 
 		 340 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 389 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  32.61 
 
 		 342 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 362 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  31.69 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 394 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 358 aa  121  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 361 aa  120  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  26.03 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 367 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  28.38 
 
 		 379 aa  118  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 357 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 		 377 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 446 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.58 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 357 aa  114  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  33.78 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  34.78 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  33.03 
 
 		 382 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 578 aa  111  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 		 374 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 403 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  33.16 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  33.52 
 
 		 372 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.56 
 
 		 381 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 388 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 390 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  27.64 
 
 		 346 aa  107  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 		 374 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  30.36 
 
 		 360 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 347 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 482 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  33.13 
 
 		 345 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  30.05 
 
 		 352 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  26.97 
 
 		 369 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  27.06 
 
 		 420 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 394 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 		 351 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.19 
 
 		 343 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 366 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  30.08 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  32.77 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  30.08 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  30.08 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  31.93 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  32.35 
 
 		 364 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 345 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 1016 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 392 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 563 aa  101  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  33.01 
 
 		 336 aa  101  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  32.22 
 
 		 518 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 		 394 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 465 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 350 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 336 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  30.08 
 
 		 449 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 359 aa  100  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.77 
 
 		 414 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  29.59 
 
 		 360 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  32.42 
 
 		 556 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 355 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 353 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.76 
 
 		 831 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 344 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 426 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  29.94 
 
 		 432 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 419 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 		 568 aa  98.6  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.71 
 
 		 563 aa  98.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  32.28 
 
 		 350 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  33.98 
 
 		 356 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 357 aa  98.2  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.51 
 
 		 380 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  24.36 
 
 		 387 aa  98.2  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 		 572 aa  97.8  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 410 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 561 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 561 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 331 aa  97.8  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 561 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.32 
 
 		 428 aa  97.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.67 
 
 		 455 aa  97.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 561 aa  97.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 257 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  30.61 
 
 		 576 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  31.13 
 
 		 567 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 352 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 		 568 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>