More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04139 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  100 
 
 		 350 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  71.64 
 
 		 338 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  64.41 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  64.58 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  39.41 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  37.64 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  38.6 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  38.95 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.53 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  39.67 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  40.2 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  42.53 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  34.02 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  44.93 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  39.51 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  35.07 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  33.22 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  38.76 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  42.57 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  42.38 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  36.43 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  33.71 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  36.91 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  34.38 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  36.16 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  45.99 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  43.15 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  39.74 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  40.87 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  40.87 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  35.1 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 572 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 572 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  34.44 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 645 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 578 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.41 
 
 		 563 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  35.87 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.88 
 
 		 556 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 465 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  33.5 
 
 		 560 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 557 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  35.43 
 
 		 556 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  36.22 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.63 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  36.02 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  33.99 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 558 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  35.98 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  37.58 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.47 
 
 		 563 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  35.93 
 
 		 576 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  32.43 
 
 		 566 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  37.17 
 
 		 576 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  33 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  33 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  33 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  41.84 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  41.84 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 563 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.06 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 		 581 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.65 
 
 		 572 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 558 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  36.65 
 
 		 568 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  35.36 
 
 		 561 aa  99.4  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.86 
 
 		 576 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.84 
 
 		 726 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  35.23 
 
 		 558 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  32.02 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  37.27 
 
 		 565 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 560 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 560 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.35 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 560 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>