More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1434 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  100 
 
 		 369 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  47.46 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  40.11 
 
 		 340 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  43.79 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  42.37 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  35.69 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.46 
 
 		 346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  37.39 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  37.69 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  40.43 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  39.29 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  33.7 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.61 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  36.72 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  35.34 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  34.03 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  36.69 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  35.6 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  37.83 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  35.6 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  34.56 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  34.56 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  37.45 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  37.45 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  37.1 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  33.54 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  36.63 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  36.63 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  36.84 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 426 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.96 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 561 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  28.96 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.96 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  28.94 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  30.96 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 561 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 561 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30.51 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  32.43 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  29.69 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  27.64 
 
 		 563 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.56 
 
 		 393 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 578 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  28.73 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  33.6 
 
 		 455 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  26.34 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  27.34 
 
 		 482 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.25 
 
 		 576 aa  92.8  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.82 
 
 		 576 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.86 
 
 		 465 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  26.05 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  29.32 
 
 		 408 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  28.02 
 
 		 562 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 560 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 		 831 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  25.99 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 560 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  29.96 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 565 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  34.27 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  28.46 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 491 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  27.53 
 
 		 565 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  29.67 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  36.7 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  26.97 
 
 		 556 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  28.9 
 
 		 560 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  26.61 
 
 		 557 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  26.61 
 
 		 557 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  26.61 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  25.81 
 
 		 581 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  28.4 
 
 		 557 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>