More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4381 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 377 aa  769    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  61.05 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  42.01 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  39.87 
 
 		 357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  35.85 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  37.85 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.22 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.07 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.79 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  37.78 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 586 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  38.69 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  30.98 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.77 
 
 		 580 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  33.83 
 
 		 642 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.7 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.71 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  33.88 
 
 		 362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.8 
 
 		 576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  33.64 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  30 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 645 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 491 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  33.2 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  31.6 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 		 581 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  29.45 
 
 		 603 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 482 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.16 
 
 		 568 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  32.3 
 
 		 576 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  31.86 
 
 		 575 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 		 581 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 572 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 558 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 572 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 565 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  29.65 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  31.4 
 
 		 607 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.4 
 
 		 578 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  33.17 
 
 		 565 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 565 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  32.96 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  33.17 
 
 		 565 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  32.35 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 565 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 566 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 502 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.52 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  28.89 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  33.17 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  30.65 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  28.69 
 
 		 726 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  25.18 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.88 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  34.54 
 
 		 556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  27.4 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.61 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  31.54 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  31.62 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.9 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 1016 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  28.23 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.78 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  29.33 
 
 		 577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>