More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0069 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 400 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  58.2 
 
 		 411 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  56.53 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  56.85 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  55.59 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  54.18 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  57.41 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  55.5 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  54.62 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  52.36 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  54.33 
 
 		 408 aa  356  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  52.04 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  49.34 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  45.59 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  49.2 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  44.25 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  45.4 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  49.33 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  49.33 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  49.33 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  47 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  39.95 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  39.28 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  39.94 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.94 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  50.44 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  37.43 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  37.14 
 
 		 576 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  56.19 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.76 
 
 		 578 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.44 
 
 		 572 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  52.63 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.99 
 
 		 576 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.73 
 
 		 580 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.08 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 		 568 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  33.8 
 
 		 440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 		 603 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 564 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 568 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.4 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  28.4 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  30.08 
 
 		 569 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  32.32 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 589 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  31.11 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  32.7 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  32.04 
 
 		 589 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  32.32 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  32.32 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  32.32 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  32.32 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  32.32 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.85 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.85 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  28.61 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  32.04 
 
 		 589 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.85 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  28.89 
 
 		 558 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.77 
 
 		 589 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  28.45 
 
 		 558 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 		 557 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 		 557 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 557 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  39.76 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  26.92 
 
 		 591 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 561 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  29.4 
 
 		 556 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  28.53 
 
 		 561 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 561 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 		 591 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 572 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30.43 
 
 		 575 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  27.95 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  28.21 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  26.89 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  27.76 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 566 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.01 
 
 		 562 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>