More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2857 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 363 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  70.9 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  47.73 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  52.08 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  47.62 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  48.34 
 
 		 411 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  45.11 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  48.68 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  45.58 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  44.66 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  46.22 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  46.05 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  43.85 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  47.7 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  47.7 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  47.7 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  46.97 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  44.13 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  53.73 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  42.9 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  51.3 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  43.28 
 
 		 432 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  42.29 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  49.37 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  39.42 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  30.45 
 
 		 450 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 578 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.42 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  29.3 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.83 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  39.62 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  37.22 
 
 		 576 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  39.57 
 
 		 572 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  38.84 
 
 		 576 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 		 568 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 580 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  32.65 
 
 		 603 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 645 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.8 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.55 
 
 		 567 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  34.05 
 
 		 572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 		 572 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 557 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 557 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 557 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 410 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  35.32 
 
 		 557 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  36.23 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  36.23 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  36.23 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  36.23 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 559 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  33.93 
 
 		 557 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.93 
 
 		 557 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.23 
 
 		 563 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  31.72 
 
 		 563 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  35.1 
 
 		 561 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  31.72 
 
 		 560 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  34.56 
 
 		 581 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  34.7 
 
 		 559 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  37.13 
 
 		 403 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  30.68 
 
 		 558 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  37.86 
 
 		 438 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  35.07 
 
 		 443 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 568 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  34.4 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 558 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  33.66 
 
 		 603 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  34.31 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  28.74 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  28.84 
 
 		 557 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  35.27 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 560 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 560 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 560 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 		 581 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  33.92 
 
 		 560 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.92 
 
 		 560 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  31.72 
 
 		 565 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 		 654 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 561 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>