More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1394 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
393 aa  782    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  83.7 
 
 
405 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  60.16 
 
 
394 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  58.31 
 
 
398 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  59.2 
 
 
411 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  58.1 
 
 
391 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  55.68 
 
 
374 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  56.58 
 
 
394 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  56.35 
 
 
400 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  53.87 
 
 
408 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  55.08 
 
 
394 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  54.55 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  47.85 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  49.56 
 
 
432 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  51.48 
 
 
409 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  52.13 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  50.4 
 
 
408 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  52.01 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  52.01 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  52.01 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  45.27 
 
 
394 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  41.65 
 
 
428 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  46.22 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  39.4 
 
 
455 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.57 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  44.12 
 
 
338 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  39.22 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  39.2 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 
426 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  42.73 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.87 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.39 
 
 
578 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 
580 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.16 
 
 
576 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.7 
 
 
567 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
572 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.75 
 
 
568 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  31.24 
 
 
603 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 
568 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  30.87 
 
 
431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.94 
 
 
563 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  32.09 
 
 
440 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 
557 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 
557 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 
557 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 
564 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.75 
 
 
561 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 
557 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 
557 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 
557 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
565 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 
433 aa  159  9e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
561 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
565 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  40.18 
 
 
403 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
561 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  28.61 
 
 
558 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 
559 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  28.25 
 
 
561 aa  156  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  28.05 
 
 
565 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  31.18 
 
 
575 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  27.21 
 
 
522 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  27.45 
 
 
572 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  28.18 
 
 
589 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  27.48 
 
 
572 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  29.78 
 
 
561 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
561 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
561 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
561 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  26.84 
 
 
558 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
561 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  26.58 
 
 
557 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  30.72 
 
 
568 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  29.7 
 
 
576 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  29.97 
 
 
561 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  29.71 
 
 
565 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  29.71 
 
 
565 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  29.71 
 
 
565 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  29.71 
 
 
559 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
559 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
559 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 
563 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
561 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  29.53 
 
 
581 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 
562 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
559 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
559 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>