More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0276 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  73.56 
 
 
565 aa  823    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  64.04 
 
 
561 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  61.4 
 
 
577 aa  693    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  73.56 
 
 
565 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  73.74 
 
 
565 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  64.5 
 
 
576 aa  728    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  64.75 
 
 
561 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  64.75 
 
 
561 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  59.79 
 
 
568 aa  652    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  63.86 
 
 
561 aa  718    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  61 
 
 
575 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  76.7 
 
 
572 aa  884    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  64.75 
 
 
561 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  64.75 
 
 
561 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  64.75 
 
 
561 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  66.79 
 
 
563 aa  747    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  64.04 
 
 
561 aa  720    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  64.04 
 
 
561 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  67.03 
 
 
561 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  65.83 
 
 
563 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  76.7 
 
 
572 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
561 aa  1142    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  77.18 
 
 
561 aa  874    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  63.49 
 
 
562 aa  695    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  55.22 
 
 
558 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  54.69 
 
 
556 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  56.4 
 
 
560 aa  631  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  56.83 
 
 
569 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  56.83 
 
 
565 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  55.86 
 
 
565 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  54.33 
 
 
556 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  55.68 
 
 
565 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  55.7 
 
 
558 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  55.68 
 
 
565 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  55.68 
 
 
565 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  55.5 
 
 
560 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  55.5 
 
 
560 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  54.05 
 
 
557 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  55.32 
 
 
560 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  54.79 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  55.3 
 
 
556 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  55.5 
 
 
560 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  55.5 
 
 
560 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  55.86 
 
 
558 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  47.66 
 
 
559 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  47.47 
 
 
560 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  47.29 
 
 
560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  45.88 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  38.61 
 
 
576 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  38.62 
 
 
578 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  39.96 
 
 
572 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.33 
 
 
576 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  35.79 
 
 
564 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  37.28 
 
 
568 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.04 
 
 
567 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.27 
 
 
568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 
580 aa  277  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
579 aa  273  7e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  31.8 
 
 
591 aa  270  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  33.39 
 
 
603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.96 
 
 
589 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  32.76 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 
591 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  32.96 
 
 
579 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.52 
 
 
589 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.52 
 
 
589 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.52 
 
 
589 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.52 
 
 
589 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.52 
 
 
589 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.35 
 
 
589 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.18 
 
 
589 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.35 
 
 
589 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  32.01 
 
 
587 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  31 
 
 
581 aa  256  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 
566 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.98 
 
 
581 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  33.07 
 
 
522 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 
566 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.93 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.8 
 
 
581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 
557 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 
557 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 
557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 
552 aa  239  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.21 
 
 
565 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 
565 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.21 
 
 
565 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 
557 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 
557 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
559 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
559 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
559 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 
559 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
559 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>