More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2674 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 374 aa  751    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  66.01 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  58.31 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  38.55 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  35.42 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  42.04 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  37.7 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  41.7 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  40.32 
 
 		 642 aa  169  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  41.81 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 586 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  39.74 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.5 
 
 		 607 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  37.07 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  35.49 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  37.44 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.75 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.76 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 422 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  37.09 
 
 		 576 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.54 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 382 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  34.11 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  36.02 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  33.67 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  31.97 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.91 
 
 		 394 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  33.06 
 
 		 566 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  34.12 
 
 		 1016 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  32.29 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  38.05 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  31.1 
 
 		 565 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.52 
 
 		 565 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  30.52 
 
 		 565 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.52 
 
 		 565 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 559 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 559 aa  122  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 559 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 559 aa  122  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 559 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  30.52 
 
 		 559 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  28.21 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  35.81 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  34.96 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.02 
 
 		 576 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 557 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 557 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 561 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  30.23 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.33 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  33.2 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.05 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  32.7 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 557 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 557 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 568 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  29.4 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  43.41 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  29.52 
 
 		 594 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  31.33 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.53 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  36.02 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>