More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3912 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 382 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  46.18 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  41 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  43.57 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  30.87 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  41.23 
 
 		 586 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  36.17 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  34.93 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  36.22 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  32.65 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  36.94 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  38.42 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  35.21 
 
 		 642 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  31.25 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.06 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  33.88 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  33.22 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  32.8 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  36.62 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  34.43 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.94 
 
 		 607 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  33.51 
 
 		 556 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  32.66 
 
 		 726 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  30.23 
 
 		 587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  33.51 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.95 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  33.5 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  34.41 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 559 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  30.36 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  34.64 
 
 		 645 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  28.35 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.21 
 
 		 576 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  40.12 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  33.06 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 		 495 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  28.4 
 
 		 443 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.78 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  39.66 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  33.67 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  34.31 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.57 
 
 		 565 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 		 565 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.57 
 
 		 565 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 559 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 559 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 559 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 		 559 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 559 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 831 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  31.79 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 569 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 600 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.26 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  27.85 
 
 		 597 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.24 
 
 		 567 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  26.38 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 		 1051 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.07 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  26.72 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  30.65 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 581 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 565 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 357 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  30.47 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  25.64 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>