More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2134 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 387 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  40.52 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  38.81 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  33.42 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  38.24 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  43.24 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  38.53 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  39.52 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  37.93 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 518 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  36.61 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  36.53 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  35.32 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  41.29 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  41.12 
 
 		 364 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  42.11 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  40.31 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  38.03 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  36.4 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  38.39 
 
 		 364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  36.96 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  39.58 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  39.2 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  37.62 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.21 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  35.58 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  32.05 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  40.44 
 
 		 360 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  37.75 
 
 		 355 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 347 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  32.88 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  37.25 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  29.77 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  29.78 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.43 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.55 
 
 		 576 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  28.52 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  34.57 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  31.77 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  30.72 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  25.54 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  30.37 
 
 		 580 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 645 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 394 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.44 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  28 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  24.36 
 
 		 726 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  25.84 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 569 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.57 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.65 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  25.6 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  33.15 
 
 		 556 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.37 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  26.88 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  28.82 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  28.16 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  28 
 
 		 257 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  27.8 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  32.6 
 
 		 556 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4248  sensor histidine kinase  28 
 
 		 257 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.31 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  27.49 
 
 		 594 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  31.74 
 
 		 552 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>