More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0763 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 343 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  34.71 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  32.12 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  33.22 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  35.19 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  33.87 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  40.49 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  38.81 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  40.58 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  29.39 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  39.61 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  30.75 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  37.32 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  37.38 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  30.61 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  37.1 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.49 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  27.87 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  39.15 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  39.02 
 
 		 501 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  28.37 
 
 		 504 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  27.18 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  26.51 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  35.35 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 346 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  27.11 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  32.95 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  36.12 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  29.59 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  34.85 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.23 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  31.96 
 
 		 353 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  29.13 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.33 
 
 		 370 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  29.41 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  26.19 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  29.24 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  34.18 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.63 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  29.09 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  25.65 
 
 		 726 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.72 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  26.57 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  24.64 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  27.32 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  25.97 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3518  two component sensor protein  27.66 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  23.76 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.48 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.34 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  26.84 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  27.45 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  25.43 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  28.27 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  28.02 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  26.32 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  26.56 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  26.53 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  29.23 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  26.94 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  30.77 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>