More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4523 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 365 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  52.16 
 
 		 351 aa  358  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  47.09 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  36.64 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  33.14 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  43.16 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  36.53 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  41.21 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  40.44 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  30.08 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  39.6 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  30.75 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  32.07 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  31.33 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  31.38 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  38.07 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  36.28 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  39.5 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  33.74 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  37.11 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  29.25 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  29.2 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  27.87 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  31.51 
 
 		 364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  37.75 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  36.68 
 
 		 381 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  28.2 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  26.84 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 501 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  37.06 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  36.55 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  26.32 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  25.65 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  38.12 
 
 		 345 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  28.87 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  33.14 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  33.98 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  33.33 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.29 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  32.65 
 
 		 469 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 362 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  28.97 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  28 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  28.8 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  27.31 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  34.41 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  32 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  32.54 
 
 		 726 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  28.38 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  27.32 
 
 		 563 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.29 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  25.41 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  33.15 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.06 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  27.04 
 
 		 645 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  31.34 
 
 		 594 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  29.07 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 565 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  23.37 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  28.72 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  26.53 
 
 		 558 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  26.73 
 
 		 572 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  26.77 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  26.73 
 
 		 572 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>