More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0148 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 594 aa  1194    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  33.84 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  31.08 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.8 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  25.95 
 
 		 587 aa  204  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  25.88 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 585 aa  170  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  27.26 
 
 		 567 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  28.52 
 
 		 623 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  32.95 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  30.19 
 
 		 604 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  36.16 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  34.31 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  31.33 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 583 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.32 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  32.09 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 580 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  24.92 
 
 		 589 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  32.01 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  24.79 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 426 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  29.24 
 
 		 600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  28.34 
 
 		 603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 410 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.8 
 
 		 607 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  36.24 
 
 		 557 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 578 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  36.24 
 
 		 557 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  36.24 
 
 		 557 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  28.48 
 
 		 597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 557 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35 
 
 		 576 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 465 aa  134  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 578 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 557 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 557 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 483 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  24.59 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  29.83 
 
 		 488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  37.38 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  39.61 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.98 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  32.95 
 
 		 577 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 574 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  38.35 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  38.35 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  38.35 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  33.48 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  30.25 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  38.35 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  39.41 
 
 		 581 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  24.36 
 
 		 600 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.67 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 578 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  39.02 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  32.77 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  29.92 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  34.23 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  28.9 
 
 		 393 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.84 
 
 		 568 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  34.19 
 
 		 433 aa  120  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 640 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  28.01 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 1016 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 580 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  33.48 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  29.69 
 
 		 390 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  31.66 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 408 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  30.64 
 
 		 581 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 257 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 394 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  37.81 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.94 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  35.44 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  28.52 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 358 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  29.09 
 
 		 391 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>