More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6982 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 324 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  28.53 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 518 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  37.88 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 418 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  31.32 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  36.27 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  35.32 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  28.32 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  27.37 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 501 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  32.05 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  30.2 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 381 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  31.75 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  27.09 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  29.5 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  23.98 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.22 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  35.18 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 446 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  27.97 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  35.64 
 
 		 389 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  30.96 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  31.36 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  28.36 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  29.58 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  27.76 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  30.24 
 
 		 469 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  28.5 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.69 
 
 		 726 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  28.64 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.43 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  28.51 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  26.38 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  29.46 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  32.39 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  27.95 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  31.89 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  26.03 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  26.88 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  34.64 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  32.43 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  26.34 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.13 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  23.6 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  27.31 
 
 		 578 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  29.48 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  24.21 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.44 
 
 		 563 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  29.47 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  27.23 
 
 		 1021 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.65 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  26.29 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  26.55 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  28.51 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.87 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  28.36 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>