More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4711 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 394 aa  809    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  40.31 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  33.42 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  33.42 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  30.63 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  41.26 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  30.75 
 
 		 365 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  39.71 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  40.5 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  42.57 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  36.48 
 
 		 369 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  38.61 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  41.15 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  39.53 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  28.5 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  38.42 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 364 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  38.97 
 
 		 501 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  38.97 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  32.07 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  29.94 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  37.32 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 518 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  26.96 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  37.97 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  29.69 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  38.24 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 		 331 aa  126  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  38.97 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  32.78 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  35.82 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 362 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  29.27 
 
 		 831 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  34.87 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  31.41 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  25.87 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  34.74 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  28.84 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  32.46 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  29.86 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  34.86 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 		 352 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.86 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  29.68 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  28.26 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.92 
 
 		 576 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  31.03 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  28.08 
 
 		 603 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  34.15 
 
 		 565 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  32.04 
 
 		 577 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  34.87 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  35.5 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 557 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 566 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 581 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  29.52 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 362 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  28.88 
 
 		 567 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 565 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 559 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 559 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  32.74 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 559 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>