More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1835 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 332 aa  674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  36.55 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  27.39 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  38.42 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  35.75 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 518 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  38.98 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  34.41 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  36.32 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  34.74 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  33.67 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  31.37 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  27.67 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  28.79 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 504 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  29.29 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 501 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  27.2 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  28.7 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  31.32 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  28.79 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  28.19 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.34 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  26.71 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 390 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  28.05 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  31.35 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  24.66 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  32.11 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  26.89 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  25.19 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  24.34 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  31.87 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  25.67 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  25.09 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.51 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  28.19 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  27.51 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  26.47 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  24.86 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  25.97 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  28.09 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  25.96 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  26.11 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  28.46 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  27.51 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  27.13 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  23 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  24.14 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  27.42 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  27.49 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  26.07 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  27.89 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  31.85 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  26.6 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  23.45 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  27.98 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  28.44 
 
 		 594 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 645 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>