More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6668 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  100 
 
 		 469 aa  972    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  39.41 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  36.67 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  36.73 
 
 		 344 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  38.97 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 356 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  33.16 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  37.25 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  36.92 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  37.77 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  32.95 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.18 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 357 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  35.42 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  35.51 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.65 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  35.41 
 
 		 344 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  36.27 
 
 		 504 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  31.87 
 
 		 360 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  32.14 
 
 		 356 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  35.16 
 
 		 347 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  32.21 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 		 518 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 348 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  32.82 
 
 		 356 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 362 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  32.79 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  31.68 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.61 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  32.18 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  29.27 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  29.52 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  35.83 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  27.44 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  34.78 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1947  hypothetical protein  28.37 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  28.93 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 328 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  31.49 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  25.69 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  25.96 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  32.52 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  26.46 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  28.44 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  28.21 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  30.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  27.19 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  30.63 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  28.44 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  26.69 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  27.95 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  26.15 
 
 		 565 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  28 
 
 		 568 aa  73.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  31.92 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  26.25 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  29.15 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  27.81 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  29.26 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  29 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  27.7 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  31.19 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  28.74 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  28.52 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  32.24 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.69 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  28.72 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  37.1 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  30.06 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  34.29 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  34.59 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  29.13 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>