More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0825 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 353 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  42.22 
 
 		 351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  38.42 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  34.76 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  27.78 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  34.2 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  37.24 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  35.78 
 
 		 518 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  29.56 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  32.68 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  28.72 
 
 		 364 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  27.39 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  34.13 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  36.16 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  33.8 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  33.94 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 501 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  31.75 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  31.8 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.08 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  31.9 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  27.01 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  35.09 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  32.14 
 
 		 504 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 563 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.47 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  30.8 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  31.78 
 
 		 567 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 394 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 563 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.11 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.07 
 
 		 455 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 580 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.16 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 		 572 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 557 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  32.23 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 572 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 558 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  31.96 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  33.99 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 		 561 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.41 
 
 		 577 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  25.98 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 561 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 561 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 465 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  27.44 
 
 		 831 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  29.5 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 561 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  29.55 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.92 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  30.81 
 
 		 558 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  30.05 
 
 		 576 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.99 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 560 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>