More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6407 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 355 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  39.08 
 
 		 347 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  37.85 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  38.94 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  37.83 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 342 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  32.36 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  33.83 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  27.53 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  29.37 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  37.85 
 
 		 1021 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 362 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 578 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  29 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 		 523 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  29.62 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  30.74 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  28.7 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  45.45 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 561 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  48.18 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  47.27 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  46.9 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  47.41 
 
 		 831 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  31.45 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  48.18 
 
 		 561 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  42.06 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  32.33 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  42.06 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  36.87 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  34.32 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  42.06 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  29.46 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  44.62 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  31.66 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  29.56 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  43.85 
 
 		 572 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  36.22 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  30.68 
 
 		 552 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.24 
 
 		 562 aa  99.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  39.42 
 
 		 576 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  45.45 
 
 		 556 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  35.91 
 
 		 557 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  45.45 
 
 		 556 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  26.86 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  35.96 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  38.04 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  34.05 
 
 		 432 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  31.9 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  36.81 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 		 586 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 645 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.31 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  36.22 
 
 		 563 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  41.74 
 
 		 559 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  35.33 
 
 		 336 aa  96.3  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  28.2 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>