More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4913 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 445 aa  901    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  47.97 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  39.37 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  38.97 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  38.6 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  32.17 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  41.71 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  37.72 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  35.27 
 
 		 340 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.56 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  38.6 
 
 		 1021 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  28.13 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  43.46 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 		 333 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 362 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  36.07 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  33.1 
 
 		 338 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  29.71 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  30.42 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  35.75 
 
 		 359 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  37.85 
 
 		 355 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 366 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  38.38 
 
 		 351 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 364 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  37.38 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  37.91 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  29.64 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  36.56 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  35.52 
 
 		 342 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  39.78 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.99 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  26.64 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 		 362 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  26.64 
 
 		 389 aa  96.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  27.03 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 350 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  49.47 
 
 		 101 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 572 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 572 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  30.54 
 
 		 340 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 349 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 482 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.73 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  27.41 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  28.4 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.88 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 349 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  27.18 
 
 		 367 aa  87  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 361 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  26.89 
 
 		 418 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  26.13 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  27.8 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  30.77 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  25.66 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  31.06 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  37.01 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  30.11 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  23.75 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  38.6 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  24.81 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  26.24 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  26.87 
 
 		 558 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.13 
 
 		 645 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  29.56 
 
 		 1016 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  27.39 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  26.27 
 
 		 831 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  27.08 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  24.69 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  25.76 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>