More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1792 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 323 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  43 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  32.72 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  29.97 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  36.96 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  35 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.72 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  33.66 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  33.83 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  41.52 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  31.37 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 445 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  36.3 
 
 		 380 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 		 352 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  34.92 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  32.2 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  41.33 
 
 		 1021 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  31.85 
 
 		 366 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.55 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  33.96 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.03 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 831 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.58 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  29.41 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  28.16 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.16 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  29.14 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.53 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.12 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  30.95 
 
 		 563 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  36.09 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 		 558 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  26.27 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  28.99 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  26.01 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  26.5 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  35.61 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.57 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.88 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  29.29 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  28.8 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 491 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  28.24 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  29.15 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 645 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 565 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  29.15 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  31.87 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  32.88 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  31.41 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.27 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  27.24 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  31.11 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  29.7 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  35.04 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  32.33 
 
 		 572 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.04 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  32.33 
 
 		 572 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  27.09 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.21 
 
 		 562 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  27.51 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  30.19 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>