More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1316 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 372 aa  765    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  44.44 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  41.07 
 
 		 359 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  42.12 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  35.67 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  51.35 
 
 		 448 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  37.73 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  38.56 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  41.24 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  41.7 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  45.03 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  34.06 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  41.71 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  35.77 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  30.42 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  37.73 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  37.44 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  30.32 
 
 		 454 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  39.9 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  39.38 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  35.71 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  38.71 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  38.31 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  37.23 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  38.25 
 
 		 1021 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  38.05 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  37.23 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  34.6 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  34.3 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  34.12 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 446 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.14 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.03 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 645 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  37.82 
 
 		 556 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 831 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  33.03 
 
 		 642 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  26.52 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  36.97 
 
 		 556 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  35.57 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  29.88 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.08 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  25.57 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  33.81 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 465 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  35.57 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  32.78 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 		 558 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  35.42 
 
 		 558 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  38.33 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  27.57 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 586 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  34.03 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 502 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  28.4 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 556 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  30.48 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  25.62 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  33.83 
 
 		 432 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  29.8 
 
 		 566 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  37.01 
 
 		 558 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  30.81 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  31.37 
 
 		 394 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  30.77 
 
 		 560 aa  87  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  32.21 
 
 		 591 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 557 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  26.72 
 
 		 394 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  29.09 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  34.45 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  30.81 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  27.06 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  27.55 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.12 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>