More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7150 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 345 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  49.56 
 
 		 343 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  48.95 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  50 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  40.18 
 
 		 454 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  44.79 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  33.56 
 
 		 445 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  30.82 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  38.98 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  40.48 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  43.3 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  38.3 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  35.18 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  41.2 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  37.25 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  31.88 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  39.15 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  40.7 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  42.05 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  36.27 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  35.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  39.09 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  37.8 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  35.42 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  36.59 
 
 		 1021 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  36.11 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  36.24 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  36.97 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  36.55 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 523 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 		 578 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  29.97 
 
 		 359 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  30.49 
 
 		 584 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.49 
 
 		 584 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  37.89 
 
 		 558 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  35.56 
 
 		 559 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  33.01 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 572 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 572 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.12 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.24 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 		 557 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.61 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 565 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  39.02 
 
 		 556 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  34.95 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 558 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  30.1 
 
 		 589 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  31.79 
 
 		 577 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.05 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 		 562 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 561 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  35.48 
 
 		 591 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 565 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 565 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  31.69 
 
 		 561 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  31.52 
 
 		 432 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.65 
 
 		 556 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  28.89 
 
 		 465 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  29.05 
 
 		 433 aa  95.9  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  34.04 
 
 		 558 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 591 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.08 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30 
 
 		 575 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.07 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 557 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  36.59 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  29.22 
 
 		 557 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.22 
 
 		 557 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  32.22 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  37.04 
 
 		 556 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.07 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>