More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6103 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 362 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  42.3 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  33.24 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  42.18 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  41.63 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  40.43 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  35.48 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  38.71 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  43.09 
 
 		 454 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  35.82 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  32.65 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  38.79 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  42.44 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  42.27 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  37.06 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  37.19 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  35.1 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  35.74 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  37.24 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  40.91 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  39.49 
 
 		 1021 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  37.44 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  34.2 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 523 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  31.36 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.72 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  29.72 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.88 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  29.07 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.7 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  27.85 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  23.16 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 591 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  30.54 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  29.19 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  27.88 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 501 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.68 
 
 		 589 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  28.17 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  28 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  27.73 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 589 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  27.05 
 
 		 558 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  32.69 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 522 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  32.35 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.19 
 
 		 589 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 		 403 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.94 
 
 		 726 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 367 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  28.82 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  32.12 
 
 		 591 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.96 
 
 		 577 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 413 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  31.14 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>