More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1788 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 448 aa  915    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  53.59 
 
 		 359 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  46.49 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  47 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  51.35 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  46.04 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  43.56 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  42.29 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  41.36 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  46.86 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  40.91 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  42.72 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  43.65 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  40.19 
 
 		 344 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  41.84 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 342 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  43.23 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  41.88 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  38.31 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  36.68 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  41.75 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  38.12 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  39.9 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  38.74 
 
 		 342 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  38.42 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  40.1 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  40.51 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  39.08 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  38.21 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  41.27 
 
 		 1021 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  38.54 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  38.76 
 
 		 342 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  37.97 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 342 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.6 
 
 		 578 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  38.25 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  35.08 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  25.06 
 
 		 684 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  36.36 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 568 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  30.23 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.94 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  35.06 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  36.31 
 
 		 565 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  36.14 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  28.07 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.27 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  35.67 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 392 aa  96.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 		 347 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 491 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 552 aa  96.3  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  35.59 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  36.21 
 
 		 561 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  36.18 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 		 580 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.53 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  33.7 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  36.42 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  31.46 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 		 556 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.99 
 
 		 572 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.63 
 
 		 340 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 572 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.06 
 
 		 831 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 560 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 560 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.93 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  31.09 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  33.68 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  29.72 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  34.34 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  33.66 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 558 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.95 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>