More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5162 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 356 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  38.34 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  33.99 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  32.65 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  32.33 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  33.17 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  36.87 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  33.5 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  30.27 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  29.91 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 407 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 		 518 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.94 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  26.47 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  31.89 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  29.13 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  28.09 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  32.68 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.66 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  30.49 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  26.23 
 
 		 501 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  27.5 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  31.46 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  30.39 
 
 		 504 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  29.5 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.34 
 
 		 576 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  27.46 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  31.93 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  27.37 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  28.27 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  27.44 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 578 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  29.5 
 
 		 403 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  28.51 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  27.98 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  25.96 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  30.28 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.5 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  26.12 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  22.9 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  28.64 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  24.36 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4248  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  25.68 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  23.61 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  25.69 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  27.36 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  29.35 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  29.21 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.47 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.46 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  29.18 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.27 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  30.93 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  32.99 
 
 		 568 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  27.54 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.41 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  28.08 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.27 
 
 		 557 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  27.01 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>