More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2114 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 627 aa  1256    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  34.22 
 
 		 623 aa  277  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  31.19 
 
 		 567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  32.59 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  37.93 
 
 		 600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  33.02 
 
 		 603 aa  190  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  26.55 
 
 		 597 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  28.97 
 
 		 594 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  32.54 
 
 		 569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 585 aa  170  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  32.59 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 580 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  30.23 
 
 		 599 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 583 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  27.87 
 
 		 589 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  31.39 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  31.92 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 583 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  32.95 
 
 		 594 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 502 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  26.99 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  24.6 
 
 		 603 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  24.41 
 
 		 595 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 578 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  32.4 
 
 		 604 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  32.19 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  21.47 
 
 		 633 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  35.71 
 
 		 610 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  24.45 
 
 		 612 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  30.69 
 
 		 617 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 483 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  35.68 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 640 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  33.2 
 
 		 596 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  25.18 
 
 		 577 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  28.57 
 
 		 600 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  31.82 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  38.97 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  37.1 
 
 		 335 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 410 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 574 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.23 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  39.32 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  28.3 
 
 		 564 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  38.53 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  38.35 
 
 		 581 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  36.49 
 
 		 1016 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 559 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  26.6 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 		 601 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.09 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  35.78 
 
 		 566 aa  127  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  31.92 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  32.04 
 
 		 595 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  33.86 
 
 		 573 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 450 aa  124  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.72 
 
 		 426 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  32.08 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.78 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 558 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  29.75 
 
 		 374 aa  122  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 565 aa  122  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  26.15 
 
 		 586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  26.91 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 558 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  37.56 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  37.56 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  28.3 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  30.55 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  33.18 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 446 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  37.06 
 
 		 559 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  32.78 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 557 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  29.68 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  32.58 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.99 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  31.46 
 
 		 572 aa  114  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  27.73 
 
 		 408 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>