More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0672 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 289 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  35.99 
 
 		 1051 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  37.2 
 
 		 1015 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  35.21 
 
 		 650 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  31.23 
 
 		 631 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  33.93 
 
 		 1192 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  33.03 
 
 		 975 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  30.52 
 
 		 1182 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 541 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  28.65 
 
 		 729 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  35.56 
 
 		 675 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  32.71 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 684 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  35.16 
 
 		 374 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  29.46 
 
 		 671 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 603 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  26.57 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 428 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 403 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 403 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 403 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 502 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 408 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  30.12 
 
 		 587 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  32.91 
 
 		 402 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  33.13 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  32.94 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  25.37 
 
 		 478 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  35.95 
 
 		 405 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  26.91 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  26.63 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  26.51 
 
 		 409 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 392 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 398 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  31.94 
 
 		 394 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  30.54 
 
 		 390 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.69 
 
 		 580 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  26.53 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.65 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  24.63 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  24.41 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  33.53 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  25.37 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.13 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  27.1 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.81 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.23 
 
 		 600 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 568 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  25.59 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.54 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  27.85 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.81 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  25.97 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.16 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.28 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  27.75 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  30.67 
 
 		 455 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  30.49 
 
 		 582 aa  79  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  29.17 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  29.17 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  25 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  27.96 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  28.8 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  30.12 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  28.09 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  28.3 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  27.91 
 
 		 1018 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.48 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  29.08 
 
 		 586 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 559 aa  76.6  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  27.67 
 
 		 581 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.53 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  27.71 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  29.56 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  26.92 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  27.44 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>