More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01910 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  100 
 
 		 729 aa  1494    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.94 
 
 		 650 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  39.13 
 
 		 1015 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  36.29 
 
 		 1051 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  43.27 
 
 		 684 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  41.86 
 
 		 1192 aa  155  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 975 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  37.38 
 
 		 671 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  35.78 
 
 		 1182 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  34.93 
 
 		 631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  33.47 
 
 		 541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  39.88 
 
 		 675 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  38.39 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  33.01 
 
 		 612 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  28.13 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 446 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  35.37 
 
 		 390 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 390 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  32.97 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 338 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.6 
 
 		 580 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 		 374 aa  102  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  28.73 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  31.28 
 
 		 420 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 422 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  34.78 
 
 		 587 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  28.95 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  30.43 
 
 		 600 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  30.41 
 
 		 627 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  30.53 
 
 		 342 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 369 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.25 
 
 		 414 aa  98.6  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  33.03 
 
 		 431 aa  98.6  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  36.99 
 
 		 433 aa  98.6  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 389 aa  98.2  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  30.81 
 
 		 410 aa  98.2  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 580 aa  98.2  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 410 aa  97.4  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 346 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.84 
 
 		 455 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  26.67 
 
 		 289 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 		 391 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  31.73 
 
 		 440 aa  95.5  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  30.92 
 
 		 579 aa  95.1  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  38.16 
 
 		 603 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 576 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 358 aa  94.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  29.96 
 
 		 414 aa  94.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  28.52 
 
 		 654 aa  94.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 400 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 578 aa  94.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 585 aa  94.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.55 
 
 		 343 aa  94  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  27.98 
 
 		 350 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  30.69 
 
 		 340 aa  94.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 581 aa  94  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 362 aa  94  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.94 
 
 		 432 aa  94  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  29.67 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 377 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  31.21 
 
 		 1016 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  30.41 
 
 		 340 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 		 566 aa  93.2  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.07 
 
 		 393 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 		 645 aa  93.2  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  30.68 
 
 		 569 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  28.3 
 
 		 398 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 581 aa  91.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 		 374 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.73 
 
 		 594 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  36.13 
 
 		 572 aa  91.3  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  29.47 
 
 		 603 aa  90.5  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  28.99 
 
 		 610 aa  90.5  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  32.39 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  31.28 
 
 		 582 aa  90.5  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 394 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  32.97 
 
 		 596 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 367 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 586 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 589 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 522 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  28.77 
 
 		 394 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 352 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 566 aa  89.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 589 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 589 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  32.58 
 
 		 607 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  30.51 
 
 		 412 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.43 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  32.04 
 
 		 428 aa  89.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  35.86 
 
 		 405 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  30.7 
 
 		 402 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  25.73 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  25.94 
 
 		 360 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>