More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1007 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 684 aa  1420    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  39.73 
 
 		 1051 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  43.27 
 
 		 729 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  39.45 
 
 		 1192 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 1015 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 975 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  38.29 
 
 		 650 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  36.55 
 
 		 1182 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  38.38 
 
 		 541 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  35.68 
 
 		 671 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  24.55 
 
 		 631 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  36.75 
 
 		 304 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 374 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 384 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 675 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 388 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 		 369 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.94 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.45 
 
 		 391 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  35.38 
 
 		 576 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  28.24 
 
 		 390 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 389 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  25.94 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.09 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 		 465 aa  100  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  34.68 
 
 		 579 aa  99.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  23.92 
 
 		 448 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  31.33 
 
 		 394 aa  99  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 561 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 410 aa  98.2  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  32.5 
 
 		 558 aa  98.2  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 561 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 561 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  33.92 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  31.03 
 
 		 342 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  34.01 
 
 		 343 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 578 aa  95.5  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 		 352 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 358 aa  94.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 591 aa  94.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  33.11 
 
 		 346 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 379 aa  94.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  34.68 
 
 		 569 aa  94.4  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.49 
 
 		 414 aa  94.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  32.35 
 
 		 340 aa  94.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  37.58 
 
 		 558 aa  94  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 561 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 561 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  34.73 
 
 		 516 aa  94  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 561 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 561 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  40 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  36.13 
 
 		 455 aa  93.6  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 		 398 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 367 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 572 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 552 aa  92.8  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  35.12 
 
 		 563 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  33.33 
 
 		 428 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  37.12 
 
 		 642 aa  92  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 446 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 565 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 362 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 600 aa  92.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  32.72 
 
 		 586 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  30.73 
 
 		 565 aa  91.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  34.9 
 
 		 568 aa  91.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 831 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  35.86 
 
 		 562 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  39.32 
 
 		 345 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  28.96 
 
 		 607 aa  91.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.7 
 
 		 400 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.85 
 
 		 563 aa  91.3  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 438 aa  90.9  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 367 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 405 aa  90.9  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 478 aa  90.5  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 432 aa  90.5  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  29.35 
 
 		 382 aa  90.5  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.65 
 
 		 572 aa  90.5  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  33.7 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 561 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.32 
 
 		 567 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 		 559 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 580 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>