More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0149 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 1192 aa  2485    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  49.87 
 
 		 1182 aa  1199    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  45.28 
 
 		 1015 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.83 
 
 		 1105 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.13 
 
 		 1407 aa  183  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  44.34 
 
 		 1051 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  23.65 
 
 		 1418 aa  178  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  42.92 
 
 		 650 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.63 
 
 		 1114 aa  172  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.73 
 
 		 1397 aa  171  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  22.7 
 
 		 1054 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  23.54 
 
 		 1316 aa  160  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  37.66 
 
 		 684 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.96 
 
 		 1526 aa  159  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  22.93 
 
 		 1370 aa  157  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  41.86 
 
 		 729 aa  155  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  39.56 
 
 		 975 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  21.02 
 
 		 1355 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  21.89 
 
 		 1378 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  23.04 
 
 		 1384 aa  150  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.24 
 
 		 1373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  39.05 
 
 		 631 aa  148  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  21.68 
 
 		 1374 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21 
 
 		 1342 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  22.01 
 
 		 1278 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1850  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  45.81 
 
 		 790 aa  142  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.136475  hitchhiker  0.00884897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  22.41 
 
 		 1017 aa  141  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.27 
 
 		 1086 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.6 
 
 		 1093 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.55 
 
 		 1070 aa  138  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  22.55 
 
 		 1250 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  20.84 
 
 		 1388 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  21.93 
 
 		 1024 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.06 
 
 		 1313 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 1258 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  22.42 
 
 		 1053 aa  135  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  21.74 
 
 		 1070 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  20.05 
 
 		 1363 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.68 
 
 		 1414 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 675 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  21.61 
 
 		 1396 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.65 
 
 		 1498 aa  127  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  38.1 
 
 		 671 aa  127  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  22.43 
 
 		 1278 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  21.74 
 
 		 1366 aa  121  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  20.19 
 
 		 1404 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  20.26 
 
 		 1118 aa  119  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  21.69 
 
 		 1327 aa  118  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 541 aa  118  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  21.52 
 
 		 1335 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.89 
 
 		 1276 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  21.92 
 
 		 1378 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.7 
 
 		 1237 aa  116  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  28.99 
 
 		 1311 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  21.51 
 
 		 1373 aa  112  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  19.64 
 
 		 954 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 1211 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  21.28 
 
 		 1374 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  35.85 
 
 		 304 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  20.61 
 
 		 1351 aa  108  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  20.59 
 
 		 1034 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  37.66 
 
 		 478 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  20.27 
 
 		 1400 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 289 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  20.36 
 
 		 1004 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  21.45 
 
 		 1063 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.08 
 
 		 1453 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  20.24 
 
 		 1355 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  36 
 
 		 600 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.65 
 
 		 1226 aa  104  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 381 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  20.84 
 
 		 1194 aa  102  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  24.93 
 
 		 1334 aa  101  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  36.9 
 
 		 604 aa  101  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  25.96 
 
 		 579 aa  100  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  31.13 
 
 		 431 aa  100  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.53 
 
 		 1242 aa  100  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  20.1 
 
 		 1340 aa  99.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 358 aa  99.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.73 
 
 		 1079 aa  99.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 831 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  19.44 
 
 		 949 aa  99  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  29.05 
 
 		 580 aa  98.6  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  19.67 
 
 		 1347 aa  98.6  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  20.8 
 
 		 1374 aa  97.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 495 aa  97.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 374 aa  97.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 369 aa  96.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  25.25 
 
 		 591 aa  95.9  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 		 374 aa  95.5  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  39.74 
 
 		 603 aa  94.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 563 aa  94.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  28.52 
 
 		 1298 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  20.05 
 
 		 1017 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 426 aa  94.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  34.24 
 
 		 433 aa  93.6  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  27.23 
 
 		 390 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 465 aa  94  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 578 aa  93.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 502 aa  92.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>