93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0230 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0230  two-component sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 177 aa  344  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.949413  normal  0.193124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  41.72 
 
 		 692 aa  87.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.33 
 
 		 1378 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  31.36 
 
 		 1407 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  28.22 
 
 		 695 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.69 
 
 		 1342 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.36 
 
 		 1346 aa  64.3  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  28.89 
 
 		 1105 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  28.66 
 
 		 357 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  31.87 
 
 		 1093 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  26.14 
 
 		 1388 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.43 
 
 		 1397 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  30.63 
 
 		 1086 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  26.67 
 
 		 985 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.27 
 
 		 1070 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 1258 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  34.51 
 
 		 846 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  30.18 
 
 		 1054 aa  54.7  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  27.74 
 
 		 1526 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  35.8 
 
 		 1278 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  26.98 
 
 		 711 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  26.71 
 
 		 377 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  36.67 
 
 		 1347 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  28.65 
 
 		 361 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  28.89 
 
 		 1378 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  25.6 
 
 		 1404 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.56 
 
 		 1505 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  27.46 
 
 		 1355 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  35 
 
 		 1374 aa  51.2  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.93 
 
 		 1370 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.57 
 
 		 1505 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.64 
 
 		 1185 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.53 
 
 		 1175 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.57 
 
 		 1504 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.06 
 
 		 1276 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 1211 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  31.29 
 
 		 1084 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.16 
 
 		 1374 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  26.87 
 
 		 1070 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  25.15 
 
 		 1024 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  37.66 
 
 		 976 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 1453 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 1242 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  28.21 
 
 		 1017 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  24.07 
 
 		 1191 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.95 
 
 		 1355 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.74 
 
 		 1324 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.75 
 
 		 1340 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  25 
 
 		 977 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 		 1079 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1498 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  24.28 
 
 		 1034 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.7 
 
 		 1511 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25 
 
 		 1400 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.44 
 
 		 1486 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  27.04 
 
 		 1306 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.81 
 
 		 1118 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  32.32 
 
 		 1296 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  30 
 
 		 1093 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  24.24 
 
 		 967 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  27.72 
 
 		 1053 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.57 
 
 		 1504 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.79 
 
 		 1335 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 1237 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.07 
 
 		 1396 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  27.81 
 
 		 776 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  24.31 
 
 		 1363 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  28.57 
 
 		 1013 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  26.45 
 
 		 1313 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  28.95 
 
 		 975 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.77 
 
 		 1344 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1333  hypothetical protein  30.34 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.554888  normal  0.392861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  25.16 
 
 		 1008 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.54 
 
 		 1447 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  37.5 
 
 		 2374 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  23.81 
 
 		 946 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  29.46 
 
 		 1515 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.16 
 
 		 1508 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  27.01 
 
 		 1384 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  23.38 
 
 		 1373 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.16 
 
 		 1508 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  27.78 
 
 		 534 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  29.11 
 
 		 1063 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  30.41 
 
 		 987 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  27.12 
 
 		 1494 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  29.06 
 
 		 1351 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.44 
 
 		 1194 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1532  GGDEF domain-containing protein  31.18 
 
 		 1450 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.93 
 
 		 1075 aa  41.6  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.34 
 
 		 1508 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25 
 
 		 1327 aa  40.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.75 
 
 		 1508 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>