17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2091 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  33.73 
 
 
1024 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  33.47 
 
 
794 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  33.68 
 
 
744 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.47 
 
 
616 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  27.98 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  27.98 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  29.63 
 
 
897 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  28.24 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4310  hypothetical protein  25.73 
 
 
654 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  37.35 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  21.43 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1067  hypothetical protein  36.05 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.1 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.06 
 
 
352 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  23.49 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>