16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4030  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1755  hypothetical protein  41 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.459643  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2034  hypothetical protein  40.67 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3053  hypothetical protein  38.75 
 
 		 643 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2762  hypothetical protein  35.97 
 
 		 527 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2935  hypothetical protein  31.86 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000152042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3085  hypothetical protein  25.86 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.105752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  28.52 
 
 		 673 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2049  hypothetical protein  29.36 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.383654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4274  hypothetical protein  28.28 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1024 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0302  hypothetical protein  24.26 
 
 		 668 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.75986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  25.82 
 
 		 506 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  25.91 
 
 		 491 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.63 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5675  LmbE family protein  29.77 
 
 		 704 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>